A avaliação do curso é realizada através de avaliação contínua por Unidade Curricular (UC), sendo necessária uma classificação mínima de 50% para aprovação. A classificação final resulta de diferentes componentes avaliadas: 85% correspondem à avaliação das UC, que incluem tanto a componente teórica como a componente teórico-prática em farmácia, enquanto os restantes 15% dizem respeito à formação em contexto de trabalho, onde são avaliadas as competências aplicadas em ambiente profissional.